25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0563 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  62.64 
 
 
542 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1031    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  49.62 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  39.71 
 
 
529 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  41.92 
 
 
464 aa  350  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  43.99 
 
 
466 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  41.01 
 
 
476 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  38.14 
 
 
510 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  38.52 
 
 
543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  40.82 
 
 
471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  37.48 
 
 
474 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  36.64 
 
 
448 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  36.15 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  36.76 
 
 
460 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  29.56 
 
 
439 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  30.35 
 
 
476 aa  144  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  25.52 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  37.5 
 
 
457 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  36.89 
 
 
460 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  31.91 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  32.05 
 
 
464 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  37.63 
 
 
472 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  29.09 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  33.09 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  29.57 
 
 
447 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>