More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0095 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  73.84 
 
 
432 aa  654  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
436 aa  890  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  72.56 
 
 
430 aa  645  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  69.77 
 
 
431 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  66.36 
 
 
436 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  63.26 
 
 
438 aa  574  1e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  54.33 
 
 
430 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  58.14 
 
 
437 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  53.27 
 
 
431 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  54.78 
 
 
431 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  54.08 
 
 
431 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  54.55 
 
 
431 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 
431 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 
431 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53.27 
 
 
431 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  50.59 
 
 
431 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 
433 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  52.57 
 
 
431 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  50.59 
 
 
431 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  52.46 
 
 
430 aa  471  1e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 
431 aa  470  1e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
435 aa  470  1e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
435 aa  470  1e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
435 aa  469  1e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  53.04 
 
 
431 aa  465  1e-130  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
438 aa  465  1e-130  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 
435 aa  467  1e-130  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  55.04 
 
 
431 aa  468  1e-130  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 
432 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  52.46 
 
 
430 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  54.1 
 
 
430 aa  461  1e-128  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
433 aa  459  1e-128  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 
431 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  51.87 
 
 
431 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 
430 aa  454  1e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 
431 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  48.03 
 
 
431 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  53.97 
 
 
437 aa  448  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
445 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  54.71 
 
 
435 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  49.53 
 
 
431 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  5.15092e-14 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 
433 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.4766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  54.71 
 
 
435 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 
431 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 
430 aa  446  1e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
431 aa  447  1e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 
434 aa  447  1e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  52.68 
 
 
431 aa  447  1e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  51.75 
 
 
431 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  51.62 
 
 
435 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
432 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  441  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  48.83 
 
 
432 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 
435 aa  441  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  52.84 
 
 
427 aa  441  1e-122  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
434 aa  439  1e-122  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 
435 aa  440  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 
438 aa  439  1e-122  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  48.02 
 
 
431 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  51.98 
 
 
435 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
433 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  47.92 
 
 
433 aa  436  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 
435 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
435 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
435 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  51.29 
 
 
432 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 
435 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  51.28 
 
 
431 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  48.13 
 
 
431 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  6.87142e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  51.26 
 
 
435 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  46.99 
 
 
432 aa  433  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 
431 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  52.67 
 
 
434 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  52.13 
 
 
425 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
458 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  49.31 
 
 
435 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  51.97 
 
 
434 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
437 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
436 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  52.41 
 
 
435 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  51.66 
 
 
425 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  51.38 
 
 
439 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  48.97 
 
 
435 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  47.2 
 
 
451 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
438 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
433 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 
433 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 
450 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  48.36 
 
 
432 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  47.2 
 
 
451 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 
433 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>