31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0036 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
329 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  62.26 
 
 
323 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  58.68 
 
 
319 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  50.97 
 
 
319 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  46.71 
 
 
316 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  38.96 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  36.31 
 
 
457 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  39.68 
 
 
362 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  32.55 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  27.15 
 
 
310 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  29.23 
 
 
319 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  29.74 
 
 
397 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  25.42 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  22.12 
 
 
323 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  25.09 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  22.9 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  23.4 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.38 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  19.35 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  19.35 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  22.41 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  22.79 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  31.03 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  30.69 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  25.71 
 
 
327 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  20.97 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  48.44 
 
 
81 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  48.44 
 
 
90 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  57.78 
 
 
62 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  24.56 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  27.96 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>