30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3102 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  56.35 
 
 
362 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  54.59 
 
 
457 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  39.29 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  41.37 
 
 
316 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  38.98 
 
 
319 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  38.95 
 
 
329 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  38.31 
 
 
323 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  31.13 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  32.24 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  29.01 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  29.63 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  25.18 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  21.07 
 
 
317 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  21.07 
 
 
317 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  24.82 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  22.46 
 
 
317 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  31.18 
 
 
298 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  23.31 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  22.48 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  22.46 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  29.64 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  20.8 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  30.04 
 
 
302 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  22.46 
 
 
314 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  55.81 
 
 
81 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  52.27 
 
 
90 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0370  nucleoside recognition domain-containing protein  30.8 
 
 
298 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.270899  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  55.26 
 
 
62 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>