50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3054 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
108 aa  214  3e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  60.95 
 
 
107 aa  127  4e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  49.02 
 
 
108 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  49.04 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  50.94 
 
 
111 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  39.81 
 
 
110 aa  80.5  7e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  36.27 
 
 
108 aa  77  8e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  37.78 
 
 
107 aa  76.3  1e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  41.11 
 
 
95 aa  73.9  6e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  72  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 
116 aa  71.6  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 
103 aa  68.2  3e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  51.61 
 
 
106 aa  67.8  4e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  40.45 
 
 
103 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  40.45 
 
 
103 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  48.04 
 
 
105 aa  65.1  3e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  40.45 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  37 
 
 
106 aa  61.6  4e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  60.5  8e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  31.18 
 
 
109 aa  57.8  5e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  31.18 
 
 
109 aa  57.8  5e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  30.84 
 
 
107 aa  57  9e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  37.23 
 
 
103 aa  53.9  7e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  38.14 
 
 
103 aa  52.4  2e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 
109 aa  50.1  1e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  36.79 
 
 
107 aa  50.1  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.79 
 
 
107 aa  50.1  1e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  28.04 
 
 
109 aa  49.3  2e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  39.05 
 
 
107 aa  47.4  6e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  38.57 
 
 
100 aa  47.4  6e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  30.39 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  28.87 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  37.38 
 
 
107 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  32.1 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  36.45 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  37.96 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  37.96 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  31.52 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  37.04 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  37.04 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  37.04 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>