30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2555 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 513 aa  1024    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 501 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.29 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 490 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  25.31 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 448 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0636  putative flippase  22.01 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.765115 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3391  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 512 aa  53.9  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  19.84 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  22.7 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 488 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>