180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0027 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  94.87 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0030  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.249196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0042  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.354382  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0090  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0081  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0096  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0072  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000117208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0022  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.099872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0034  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000221471  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0044  tRNA-Pro  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000299303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0021  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19520  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00000755205  hitchhiker  0.000000818157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0010  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0571351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0068  tRNA-Pro  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0044  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0024  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0023  tRNA-Pro  95 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0108  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0032  tRNA-Pro  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138154  hitchhiker  0.00000207581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0049  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098355  normal  0.904271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.640007  normal  0.447016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0741  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0030  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135671  decreased coverage  0.0000000375958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19810  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>