221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0044 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000299303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  92.59 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  92.59 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000321345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0021  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0071  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0006  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0058  tRNA-Pro  94.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0035  tRNA-Pro  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000101815  hitchhiker  0.00514496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0054  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000175558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>