298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0006 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0006  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0041  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0248017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0096  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0096  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.859581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6001  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0238611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0007  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0007  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.845776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00070  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000213346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0104  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000101126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0004  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4164  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4263  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000112218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0121  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000547539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0045  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0152131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0002  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.236408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4713  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43285e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4160  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5090  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0528  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000899305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4322  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000374213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5235  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000789982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000321345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0002  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0006  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000337222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0094  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000259411  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0002  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4160  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>