245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0049  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098355  normal  0.904271 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19520  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00000755205  hitchhiker  0.000000818157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0010  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0571351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0018  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0768542  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0083  tRNA-Pro  96.23 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000012865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0054  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0023  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0027  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527994  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0056  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0050    91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0013  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0024  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0022  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.099872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0044  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0006  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0029  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0030  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0015  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0034  tRNA-Pro  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129809  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0030  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.249196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0029  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0018  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.662018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0066  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.880566  normal  0.0590794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0010  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0066  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0030  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.640007  normal  0.447016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0035  tRNA-Pro  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000987265  normal  0.0118441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0042  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.354382  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA15  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0023  tRNA-Pro  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0032  tRNA-Pro  92 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0012  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.762181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna13  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0048  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0197037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0050  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0007  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0029  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.264372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0001  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0014  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0856304  normal  0.963089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0030  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135671  decreased coverage  0.0000000375958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0041  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>