More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2084 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  100 
 
 
395 aa  801    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  76.67 
 
 
393 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  74.68 
 
 
397 aa  618  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  73.47 
 
 
397 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  72.94 
 
 
396 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  71.1 
 
 
395 aa  594  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  73.08 
 
 
403 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  73.08 
 
 
403 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  72.45 
 
 
396 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  72.75 
 
 
395 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  72.12 
 
 
396 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  71.32 
 
 
395 aa  584  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  69.31 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  70.1 
 
 
402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  71.54 
 
 
399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  71.79 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  68.8 
 
 
396 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  71.28 
 
 
399 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  71.28 
 
 
399 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  70.77 
 
 
399 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  69.31 
 
 
396 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  69.04 
 
 
402 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  69.51 
 
 
391 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  69.51 
 
 
391 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
398 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
398 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  65.64 
 
 
396 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 
396 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  63.5 
 
 
406 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 
395 aa  532  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 
395 aa  532  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 
397 aa  533  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  63.24 
 
 
406 aa  528  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 
402 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  63.96 
 
 
405 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  65.56 
 
 
414 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 
395 aa  525  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 
406 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  63.07 
 
 
401 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  65.21 
 
 
395 aa  522  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 
405 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0675  methionine adenosyltransferase  67.18 
 
 
401 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  63.33 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  65.73 
 
 
403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  65.06 
 
 
398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  65.89 
 
 
391 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  64.95 
 
 
391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
405 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
397 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  63.5 
 
 
398 aa  510  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  64.38 
 
 
395 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  64.36 
 
 
402 aa  511  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  63.43 
 
 
384 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
384 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 
383 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  64.71 
 
 
403 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 
381 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  64.54 
 
 
412 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
383 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 
408 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
384 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.03 
 
 
383 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  64.3 
 
 
397 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
383 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 
399 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  63.92 
 
 
421 aa  502  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
383 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
383 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
383 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 
384 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 
383 aa  501  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 
421 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  64.29 
 
 
400 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  63.87 
 
 
417 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
383 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 
384 aa  501  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  63.32 
 
 
398 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  61.12 
 
 
420 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 
383 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  63.32 
 
 
398 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  60.51 
 
 
383 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>