More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0947 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  55.86 
 
 
551 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  73.42 
 
 
554 aa  853    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  56.67 
 
 
558 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  70.2 
 
 
553 aa  815    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  55.54 
 
 
555 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  66.91 
 
 
555 aa  806    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  53.61 
 
 
560 aa  643    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  67.09 
 
 
559 aa  793    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  59.31 
 
 
566 aa  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  56.14 
 
 
618 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  59.85 
 
 
555 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  60.04 
 
 
555 aa  718    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  58.91 
 
 
555 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  62.93 
 
 
553 aa  749    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  56.44 
 
 
558 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  62.04 
 
 
555 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  63.29 
 
 
554 aa  754    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  55.21 
 
 
558 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  72.69 
 
 
554 aa  830    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  63.09 
 
 
560 aa  771    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
554 aa  1111    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  55.47 
 
 
551 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  53.08 
 
 
557 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  52.9 
 
 
557 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.08 
 
 
557 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  53.08 
 
 
557 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.26 
 
 
557 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  55.66 
 
 
551 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  55.29 
 
 
551 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  56.95 
 
 
533 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.08 
 
 
557 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.08 
 
 
557 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  53.73 
 
 
558 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  53.92 
 
 
558 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  51.99 
 
 
557 aa  621  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  51.99 
 
 
557 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  53.75 
 
 
556 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  53.38 
 
 
556 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  53.38 
 
 
556 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  611  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  611  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 
556 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  53.02 
 
 
583 aa  611  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  50.91 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.93 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  54.3 
 
 
569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  51.28 
 
 
555 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  51.56 
 
 
555 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  50.55 
 
 
555 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  51 
 
 
593 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  50.54 
 
 
591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  51.9 
 
 
556 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  48.91 
 
 
548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  52 
 
 
561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  51.37 
 
 
555 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 
565 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  50.46 
 
 
553 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 
565 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  48.53 
 
 
560 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.27 
 
 
555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
552 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 
569 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  48.38 
 
 
557 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  50.36 
 
 
547 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  47.29 
 
 
556 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  47.31 
 
 
561 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  48.03 
 
 
561 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  49.28 
 
 
564 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  48.45 
 
 
572 aa  531  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.2 
 
 
560 aa  525  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  44.81 
 
 
560 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.29 
 
 
559 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
574 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
574 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  44.17 
 
 
561 aa  511  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.26 
 
 
559 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.42 
 
 
573 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  44.97 
 
 
549 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  45.37 
 
 
556 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 
590 aa  499  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  45.14 
 
 
618 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0842  metallo-beta-lactamase family protein  44.42 
 
 
568 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
561 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  42.34 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.32 
 
 
561 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  45.44 
 
 
588 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 
602 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  45.42 
 
 
554 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>