More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0181 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  48.11 
 
 		 857 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  48.11 
 
 		 857 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  49.57 
 
 		 870 aa  798    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  59.12 
 
 		 824 aa  958    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  55.31 
 
 		 812 aa  897    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  51.88 
 
 		 940 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  47.48 
 
 		 863 aa  761    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  60.12 
 
 		 817 aa  1011    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  64.07 
 
 		 811 aa  1068    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.54 
 
 		 866 aa  746    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  48.59 
 
 		 861 aa  755    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.83 
 
 		 874 aa  756    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  64.07 
 
 		 811 aa  1068    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  47.09 
 
 		 866 aa  746    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  64.07 
 
 		 811 aa  1068    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  63.95 
 
 		 811 aa  1068    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  61.03 
 
 		 830 aa  996    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  58.87 
 
 		 855 aa  986    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  52.46 
 
 		 942 aa  787    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  48.96 
 
 		 891 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  46.86 
 
 		 873 aa  770    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  62.33 
 
 		 823 aa  1016    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  46.41 
 
 		 872 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  58.68 
 
 		 814 aa  941    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  50.5 
 
 		 949 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  52.6 
 
 		 847 aa  857    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  59.33 
 
 		 843 aa  975    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  49.88 
 
 		 863 aa  771    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  58.75 
 
 		 846 aa  978    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  49.13 
 
 		 864 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  51.37 
 
 		 949 aa  774    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  64.07 
 
 		 811 aa  1068    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  47.09 
 
 		 866 aa  746    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  59.76 
 
 		 842 aa  996    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  61.48 
 
 		 824 aa  990    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  46.7 
 
 		 883 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  65.87 
 
 		 840 aa  1043    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  51.31 
 
 		 870 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  63.22 
 
 		 834 aa  994    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  46.85 
 
 		 865 aa  748    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  48.54 
 
 		 879 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  52.12 
 
 		 949 aa  783    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  49.32 
 
 		 961 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  48.61 
 
 		 879 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  48.85 
 
 		 878 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  51.9 
 
 		 818 aa  802    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  48.73 
 
 		 878 aa  770    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  47.17 
 
 		 862 aa  753    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  47.47 
 
 		 859 aa  747    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  50.25 
 
 		 946 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  49.01 
 
 		 848 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  62.64 
 
 		 847 aa  968    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  56.55 
 
 		 837 aa  849    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  56.72 
 
 		 886 aa  834    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  60.49 
 
 		 834 aa  980    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  48.4 
 
 		 891 aa  760    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  50 
 
 		 848 aa  828    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.83 
 
 		 814 aa  880    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.04 
 
 		 814 aa  875    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  61.91 
 
 		 825 aa  1006    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  58.33 
 
 		 825 aa  959    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  53.43 
 
 		 864 aa  745    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  60.85 
 
 		 828 aa  1019    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  50.5 
 
 		 953 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  50.93 
 
 		 850 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  50.61 
 
 		 823 aa  828    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.32 
 
 		 838 aa  787    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  53.37 
 
 		 826 aa  830    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  62.25 
 
 		 830 aa  985    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  47.64 
 
 		 889 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  50.25 
 
 		 946 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  48.46 
 
 		 873 aa  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  62.95 
 
 		 839 aa  1004    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  50.64 
 
 		 864 aa  773    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  49.15 
 
 		 873 aa  770    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  52.96 
 
 		 854 aa  869    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  61.43 
 
 		 861 aa  976    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  48.05 
 
 		 857 aa  749    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  49.01 
 
 		 848 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  62.64 
 
 		 847 aa  968    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  49.36 
 
 		 848 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  62.89 
 
 		 847 aa  983    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  51.94 
 
 		 949 aa  785    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  59.37 
 
 		 842 aa  997    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  59.09 
 
 		 843 aa  990    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  58.87 
 
 		 855 aa  987    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  58.89 
 
 		 859 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  63.41 
 
 		 818 aa  1085    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  49.01 
 
 		 848 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  62.77 
 
 		 847 aa  980    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  59.44 
 
 		 841 aa  996    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  69.72 
 
 		 812 aa  1161    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  62.64 
 
 		 847 aa  965    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  57.94 
 
 		 840 aa  900    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  57.01 
 
 		 848 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  62.3 
 
 		 844 aa  984    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3072  protein disaggregation chaperone  48.45 
 
 		 857 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000111727  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2370  ATPase  51.88 
 
 		 947 aa  780    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0304669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2583  ATPase  48.26 
 
 		 848 aa  800    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.444308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  46.74 
 
 		 867 aa  751    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>