17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2606 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  44.85 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  40.93 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  40.41 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  38.34 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.86 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  29.68 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  32.46 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  29.03 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 225 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 225 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1690  hypothetical protein  31.58 
 
 		 533 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.095239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>