25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2162 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  45.14 
 
 		 723 aa  644    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  47.13 
 
 		 719 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  46.14 
 
 		 720 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1462    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  39.34 
 
 		 702 aa  499  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  32.63 
 
 		 726 aa  251  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  32.63 
 
 		 726 aa  250  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  29.78 
 
 		 824 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  29.87 
 
 		 830 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 830 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  28.08 
 
 		 662 aa  90.9  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  24.3 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  26.15 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  25.05 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  26.85 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  23.42 
 
 		 593 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  26.47 
 
 		 588 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  18.61 
 
 		 619 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  22.63 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  20.11 
 
 		 615 aa  49.3  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  21.85 
 
 		 632 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  21.99 
 
 		 541 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.21 
 
 		 725 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.47 
 
 		 732 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.42 
 
 		 785 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>