27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0011 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  42.96 
 
 
151 aa  126  8e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  38.19 
 
 
158 aa  119  2e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  38.19 
 
 
173 aa  115  2e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  41.13 
 
 
152 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  40.97 
 
 
169 aa  110  7e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  34.06 
 
 
152 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  37.32 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  34.23 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
140 aa  84.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  37.4 
 
 
167 aa  84  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.94 
 
 
155 aa  82  2e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
146 aa  80.5  7e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
146 aa  80.1  9e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  78.2  3e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  27.66 
 
 
146 aa  78.2  4e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  35.2 
 
 
151 aa  76.6  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  29.17 
 
 
163 aa  67  8e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  25.35 
 
 
181 aa  57  8e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  25 
 
 
147 aa  52.4  2e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  27.94 
 
 
180 aa  52  3e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  23.24 
 
 
178 aa  52  3e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  23.45 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  26.15 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  44.62 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  27.42 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>