More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0022 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  100 
 
 
388 aa  796    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  48.17 
 
 
395 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  47.57 
 
 
391 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.41 
 
 
391 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.64 
 
 
389 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.4 
 
 
396 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  46.74 
 
 
393 aa  348  9e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.04 
 
 
389 aa  347  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  45.17 
 
 
395 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  44.47 
 
 
395 aa  346  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  47.14 
 
 
396 aa  346  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  46.88 
 
 
396 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  46.09 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  46.09 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  43.52 
 
 
428 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.52 
 
 
391 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 
390 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  43.86 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  42.12 
 
 
404 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  43.96 
 
 
395 aa  338  8e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.09 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  44.16 
 
 
396 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  44.16 
 
 
396 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.19 
 
 
396 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.26 
 
 
395 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.91 
 
 
391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.56 
 
 
384 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.36 
 
 
390 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  41.67 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.5 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  42.52 
 
 
395 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  42.52 
 
 
395 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.24 
 
 
381 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  43.09 
 
 
396 aa  318  9e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.56 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  39.49 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  41.36 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.15 
 
 
396 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.55 
 
 
501 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  40.92 
 
 
395 aa  308  6.999999999999999e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.4 
 
 
384 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.37 
 
 
380 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.9 
 
 
396 aa  305  8.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  42.97 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.9 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  41.3 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  40.54 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.02 
 
 
386 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.49 
 
 
398 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.31 
 
 
395 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
404 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  41.04 
 
 
399 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0554618  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.18 
 
 
395 aa  300  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.79 
 
 
394 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.31 
 
 
395 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.31 
 
 
395 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.31 
 
 
395 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.05 
 
 
394 aa  299  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.5 
 
 
392 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 
395 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.43 
 
 
395 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.43 
 
 
395 aa  295  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.75 
 
 
390 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.32 
 
 
389 aa  295  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.39 
 
 
399 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.42 
 
 
381 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.53 
 
 
400 aa  293  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 
400 aa  293  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.72 
 
 
404 aa  293  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.55 
 
 
398 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  41.24 
 
 
416 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.82 
 
 
397 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.55 
 
 
398 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  37.43 
 
 
403 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.72 
 
 
400 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02519  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.53 
 
 
402 aa  288  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.253704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.51 
 
 
397 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.31 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.08 
 
 
395 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3628  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.08 
 
 
395 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0804  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.7 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145956  normal  0.0180987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 
400 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.18 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.07 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.62 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  39.84 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.02 
 
 
399 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.94 
 
 
386 aa  282  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.22 
 
 
389 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.22 
 
 
389 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.1 
 
 
395 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.58 
 
 
392 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>