More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0602 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 
568 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  73.62 
 
 
561 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
557 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
562 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 
569 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 
561 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
562 aa  661    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 
562 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 
556 aa  729    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
561 aa  1142    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
564 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
562 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 
563 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
594 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
594 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
594 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
594 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
594 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
594 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
594 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
594 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
598 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
561 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
561 aa  611  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
593 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
569 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
593 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
594 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
593 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
593 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
593 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
593 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
596 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
595 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
569 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
596 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
561 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
602 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 
561 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
577 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
558 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
567 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
565 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
596 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
565 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
586 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1977  arginyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
575 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
589 aa  515  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
592 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
586 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
584 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
592 aa  502  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
587 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
557 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
556 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
585 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
556 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
586 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 
556 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
556 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
556 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
556 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
556 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
556 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
611 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
556 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
556 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
556 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
556 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
588 aa  472  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
553 aa  463  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
553 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
553 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
609 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
575 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
554 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
563 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
551 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
550 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
556 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
587 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
609 aa  438  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
564 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
550 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
551 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
560 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
587 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
566 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
551 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>