52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0773 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  46.94 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  38.68 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  35.25 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  32.68 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  34.53 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  29.71 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  32.58 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  30.46 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  31.16 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  30.89 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  37.76 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  29.63 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  33.1 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  26.52 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  28.26 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  27.07 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  27.34 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  30.43 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  33.82 
 
 		 199 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  31.62 
 
 		 177 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  32.82 
 
 		 147 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  27.74 
 
 		 148 aa  52.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  52.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  29.53 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  43.75 
 
 		 147 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  29.77 
 
 		 185 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  25.56 
 
 		 182 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  28.38 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  26.56 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  27.7 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  25.78 
 
 		 194 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  25.78 
 
 		 194 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  26.56 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  29.46 
 
 		 191 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  29.46 
 
 		 191 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  25.78 
 
 		 194 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  31.06 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  27.74 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  28.24 
 
 		 176 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  25.97 
 
 		 150 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>