More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3006 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  100 
 
 
462 aa  959    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  59.87 
 
 
466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  56.89 
 
 
460 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  58.21 
 
 
459 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  58.46 
 
 
458 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  56.89 
 
 
461 aa  541  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  56.04 
 
 
464 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  56.6 
 
 
456 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  55.97 
 
 
458 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  56.22 
 
 
458 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56 
 
 
458 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  55.7 
 
 
458 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  55.46 
 
 
459 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  55.7 
 
 
458 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  54.44 
 
 
459 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  55.48 
 
 
461 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  55.31 
 
 
458 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.89 
 
 
458 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  52.86 
 
 
462 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  53.11 
 
 
462 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  53.11 
 
 
462 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  52.89 
 
 
462 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
462 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
462 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  52.89 
 
 
463 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  52.89 
 
 
462 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
462 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
462 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  54.92 
 
 
469 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
463 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  57.56 
 
 
441 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  53.88 
 
 
475 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
463 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  51.97 
 
 
478 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
462 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  51.42 
 
 
463 aa  485  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  51.89 
 
 
467 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
471 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  50.87 
 
 
469 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 
467 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
466 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  53.09 
 
 
467 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
467 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
464 aa  478  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  52.51 
 
 
441 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  51.35 
 
 
465 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
467 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
491 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  49.46 
 
 
473 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
460 aa  477  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
461 aa  472  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
464 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 
464 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
459 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
460 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  51.91 
 
 
459 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  53.21 
 
 
464 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
462 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
462 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
459 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  52.41 
 
 
466 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
466 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  51.68 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  51.25 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  51.6 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  52.29 
 
 
464 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
457 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 
464 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
464 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
457 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  48.36 
 
 
466 aa  463  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 
459 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
460 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  51.83 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  51.83 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
460 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  47.8 
 
 
458 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
460 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  49.77 
 
 
456 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
461 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
471 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
471 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
456 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 
462 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 
462 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  47.38 
 
 
466 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
455 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
462 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  50.91 
 
 
468 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  51.15 
 
 
464 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
466 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 
471 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  47.69 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>