21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1607 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  100 
 
 		 826 aa  1630    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 		 1332 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  33.56 
 
 		 1029 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1011 aa  87  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  34.72 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  28.04 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.16 
 
 		 834 aa  68.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  31.58 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  32.72 
 
 		 710 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.63 
 
 		 12684 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  25.86 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  25.41 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  30.77 
 
 		 509 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  25.97 
 
 		 504 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.65 
 
 		 512 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  36.59 
 
 		 518 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1610  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000510762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.99 
 
 		 497 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>