More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0372 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  100 
 
 
321 aa  650  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.76676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  62.07 
 
 
320 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  61.06 
 
 
321 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  7.35935e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1459  riboflavin kinase / FAD synthetase  57.63 
 
 
320 aa  351  8e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  6.64763e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0370  riboflavin biosynthesis protein RibF  54.21 
 
 
321 aa  343  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.125476  normal  0.302876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0405  riboflavin biosynthesis protein RibF  52.19 
 
 
321 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0771375  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.36 
 
 
308 aa  244  1e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  42.01 
 
 
307 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.96 
 
 
312 aa  239  6e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.87 
 
 
310 aa  239  6e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  42.66 
 
 
309 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.64 
 
 
309 aa  234  2e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.72 
 
 
308 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.41 
 
 
311 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.8 
 
 
311 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.06 
 
 
314 aa  220  2e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.89 
 
 
325 aa  216  6e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.71 
 
 
311 aa  215  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.03356e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.89 
 
 
311 aa  214  1e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.01 
 
 
314 aa  214  1e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.07 
 
 
310 aa  214  2e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.59125e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.07 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.07 
 
 
314 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.21 
 
 
309 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.51 
 
 
320 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.97835e-07  hitchhiker  1.24783e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.14 
 
 
309 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.28 
 
 
313 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.42 
 
 
311 aa  205  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.72 
 
 
311 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.83 
 
 
317 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0363  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.62 
 
 
309 aa  200  2e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.94086e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.44 
 
 
322 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.88 
 
 
311 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.41 
 
 
311 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.01 
 
 
314 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3568  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38 
 
 
323 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000147848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3946  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38 
 
 
323 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3660  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38 
 
 
323 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00940853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3550  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38 
 
 
323 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3820  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38 
 
 
323 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.51 
 
 
315 aa  197  2e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  196  4e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  196  4e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1001  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.88 
 
 
306 aa  196  4e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.409121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3847  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38 
 
 
323 aa  196  5e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.4 
 
 
319 aa  195  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.98 
 
 
311 aa  195  8e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1337  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  195  8e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.536973  hitchhiker  0.00905028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.98 
 
 
311 aa  195  8e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.29832e-06  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.64 
 
 
309 aa  195  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.76 
 
 
325 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.65 
 
 
306 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.63 
 
 
311 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3856  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.61391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.82 
 
 
306 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.31 
 
 
330 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.43 
 
 
323 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.83 
 
 
314 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
311 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.0021e-06  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0853  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  35.74 
 
 
305 aa  193  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.560676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3907  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.33 
 
 
323 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.37 
 
 
314 aa  192  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.98 
 
 
311 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.7 
 
 
308 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.12 
 
 
338 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  37.54 
 
 
310 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.13 
 
 
322 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00029  putative regulator  38.7 
 
 
313 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.73781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.51 
 
 
294 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.2 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3630  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.7 
 
 
313 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000550981  normal  0.819569 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00028  hypothetical protein  38.7 
 
 
313 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  9.26876e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4560  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.77 
 
 
316 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270493  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.05 
 
 
312 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1439  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.85 
 
 
325 aa  190  3e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.33 
 
 
319 aa  190  3e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.88 
 
 
320 aa  190  3e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.17202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0997  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.89 
 
 
310 aa  190  3e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0232564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1332  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.28 
 
 
323 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1412  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.91 
 
 
315 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1358  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.28 
 
 
323 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.57 
 
 
311 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.06 
 
 
312 aa  189  6e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.05 
 
 
328 aa  189  6e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.16 
 
 
310 aa  189  6e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1416  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.95 
 
 
299 aa  189  6e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3179  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.01 
 
 
308 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0023  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.84 
 
 
313 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.38833e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.59 
 
 
311 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.37633e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.55 
 
 
289 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.4 
 
 
311 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.2 
 
 
311 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0027  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.36 
 
 
313 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.89378e-06  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3574  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.36 
 
 
313 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.15482e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.82 
 
 
352 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0029  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.36 
 
 
313 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.42889e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>