More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1197 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
977 aa  1060  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 
977 aa  1105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
1053 aa  644  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
980 aa  1065  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
991 aa  2028  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  1.65985e-06  hitchhiker  3.78196e-05 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
1066 aa  661  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  1.51931e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
975 aa  649  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
977 aa  1077  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
1024 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
1062 aa  620  1e-176  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
1049 aa  614  1e-174  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
1068 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
1039 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
1039 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
1058 aa  591  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
1046 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
1058 aa  578  1e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
1076 aa  572  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
1060 aa  572  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
1059 aa  571  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
1033 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
1033 aa  559  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
1033 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
1033 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
1040 aa  556  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
1033 aa  559  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14459e-08 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
1091 aa  555  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
1033 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
1033 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
1061 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 
1068 aa  549  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
1033 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
1077 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
1033 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
1066 aa  552  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
1081 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
1033 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
1049 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
1054 aa  540  1e-152  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
1062 aa  540  1e-152  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
1065 aa  536  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439306 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
1066 aa  537  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
1069 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
1079 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
1034 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
1050 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
1034 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
1069 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
1033 aa  525  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
1068 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
1034 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
1070 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
1050 aa  521  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
1014 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
1037 aa  521  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
1059 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
1060 aa  516  1e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
1089 aa  516  1e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
1049 aa  519  1e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
1080 aa  519  1e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
1014 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
1066 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
1080 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.89774e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
1014 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
1048 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
1073 aa  512  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
1089 aa  512  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
1051 aa  508  1e-142  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
1100 aa  508  1e-142  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
1085 aa  505  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 
1084 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
1083 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
1093 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
1086 aa  502  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
1042 aa  495  1e-138  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
1091 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
1091 aa  492  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
1075 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
1110 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
1108 aa  477  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
1031 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
1056 aa  466  1e-130  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  2.25829e-08 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00705  isoleucyl-tRNA synthetase ,cytoplasmic (AFU_orthologue; AFUA_1G13710)  31.4 
 
 
1077 aa  461  1e-128  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0044  isoleucyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
1148 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
1134 aa  452  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
1036 aa  452  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4664  isoleucyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
1143 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0311577  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
1129 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
1133 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
1082 aa  440  1e-122  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0970  isoleucyl-tRNA synthetase  34 
 
 
1072 aa  439  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.853285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0688  isoleucyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
1048 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.973348  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
1137 aa  438  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
913 aa  436  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1455  isoleucyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
1072 aa  432  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79812  normal  0.434557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11569  isoleucyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
1041 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
1135 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27300  isoleucyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
1060 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.712864  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1198  isoleucyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
1061 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.649933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5753  isoleucyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
1037 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>