More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0089 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 1053 aa  1424    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 1076 aa  741    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 1060 aa  721    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 1070 aa  662    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 1089 aa  669    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 1068 aa  660    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 1024 aa  640    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 1058 aa  780    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 1040 aa  727    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 1034 aa  694    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1066 aa  2187    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 1034 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 1062 aa  744    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 1033 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 1050 aa  717    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 1068 aa  691    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 1059 aa  738    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 1058 aa  784    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 991 aa  661    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 1039 aa  638    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 977 aa  645    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 1066 aa  690    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 1049 aa  790    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 1062 aa  967    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 977 aa  651    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 1034 aa  695    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 977 aa  671    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 1039 aa  635  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 980 aa  628  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 1068 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 1091 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 1049 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 1100 aa  568  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 975 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 1033 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 1033 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 1033 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000414459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 1033 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 1033 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 1033 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 1033 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 1033 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 1033 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 1033 aa  545  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 1037 aa  543  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 1049 aa  544  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 1050 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 1046 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 1059 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 1054 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 1065 aa  531  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 1077 aa  532  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 1061 aa  529  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 1042 aa  525  1e-147  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 919 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 919 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 930 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 1066 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 920 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 1108 aa  516  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 1060 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 1069 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 927 aa  505  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 930 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 1079 aa  506  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 1036 aa  500  1e-140  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 913 aa  500  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 931 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 1069 aa  503  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 1048 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 929 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 1081 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 926 aa  498  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 1073 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 929 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 908 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 1080 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 1031 aa  496  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 1091 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 1110 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 1066 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 922 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1020  isoleucyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 916 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 931 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 920 aa  486  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 932 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 1086 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 1129 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 1137 aa  478  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1089  isoleucyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 927 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000209628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 1083 aa  478  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 1089 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0688  isoleucyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 1048 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.973348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 1056 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_002978  WD0423  isoleucyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 1111 aa  468  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1909  isoleucyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 924 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 1093 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 1080 aa  468  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 1082 aa  463  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 1085 aa  465  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>