25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1096 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1096  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  27.61 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  26.41 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  29.79 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 
259 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  23.7 
 
 
259 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
228 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  24.33 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 
325 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.89 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
242 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  25.64 
 
 
213 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>