33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0012 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  55.17 
 
 		 157 aa  125  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  51.72 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  50.86 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  50 
 
 		 153 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  53.85 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  50.76 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  38.76 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  42.97 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  42.97 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  42.19 
 
 		 135 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  41.94 
 
 		 135 aa  98.2  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  45.79 
 
 		 138 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  39.55 
 
 		 236 aa  91.3  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  47.57 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  40.46 
 
 		 335 aa  90.1  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  41.24 
 
 		 134 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  40.87 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  46.39 
 
 		 145 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  42.98 
 
 		 144 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  39.55 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  45.36 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  44.44 
 
 		 139 aa  85.1  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  43.88 
 
 		 144 aa  84.3  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  43.33 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  44.74 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  41.67 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  39.47 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  38.38 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  36.89 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  43 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  39.25 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  33.33 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>