30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1983 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  100 
 
 
150 aa  311  3e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  78.57 
 
 
149 aa  239  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  67.11 
 
 
150 aa  224  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  67.79 
 
 
151 aa  222  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  74.8 
 
 
147 aa  208  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  74.4 
 
 
167 aa  203  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  63.7 
 
 
163 aa  199  1e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  65 
 
 
144 aa  194  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  49.29 
 
 
158 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.61565e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  44.19 
 
 
155 aa  111  4e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  41.67 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  29.5 
 
 
156 aa  76.3  1e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  74.7  4e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  36.36 
 
 
314 aa  74.3  6e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  36.21 
 
 
438 aa  71.6  3e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  29.5 
 
 
151 aa  72  3e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  36.73 
 
 
155 aa  70.5  7e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  33.86 
 
 
132 aa  67.8  5e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  32.37 
 
 
158 aa  63.9  8e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  29.23 
 
 
151 aa  59.7  1e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  29 
 
 
326 aa  58.2  4e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  29.37 
 
 
162 aa  55.8  2e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 
473 aa  47  8e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  28.57 
 
 
464 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  25.89 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  26.6 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  26.6 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  26.6 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>