More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1411 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
503 aa  1007    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  66.87 
 
 
503 aa  682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  68.06 
 
 
503 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  61.42 
 
 
528 aa  631  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  61.64 
 
 
508 aa  579  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  57.2 
 
 
511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  44.66 
 
 
491 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.26 
 
 
497 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.29 
 
 
487 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 
492 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.34 
 
 
488 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  50.41 
 
 
499 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  42.77 
 
 
518 aa  349  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1710  Leucyl aminopeptidase  43.44 
 
 
501 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.055191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  49.6 
 
 
482 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
491 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  42.15 
 
 
522 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  42.27 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  39.76 
 
 
501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  43.15 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  40.39 
 
 
496 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 
521 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  40.62 
 
 
514 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  41.26 
 
 
497 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
485 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  41.25 
 
 
495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  47.53 
 
 
503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 
498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  40.67 
 
 
497 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  41.94 
 
 
503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  41.39 
 
 
496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 
510 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  38.45 
 
 
504 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  46.43 
 
 
503 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  44.47 
 
 
496 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  46.3 
 
 
496 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  46.98 
 
 
503 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  42.26 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  44.78 
 
 
502 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  46.15 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  44.57 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  46.15 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
503 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  42.52 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  47.25 
 
 
508 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
503 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
496 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  41.48 
 
 
508 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  37.55 
 
 
502 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  41.3 
 
 
500 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  39.54 
 
 
493 aa  316  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 
500 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  41.14 
 
 
510 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  45.31 
 
 
498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  37.57 
 
 
502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  47.12 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  40.23 
 
 
497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  36.72 
 
 
502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  41.82 
 
 
496 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  39.41 
 
 
497 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  39.41 
 
 
497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  41.14 
 
 
501 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  46.68 
 
 
539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  37.57 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  36.82 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  45.16 
 
 
497 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  40.32 
 
 
496 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  45.16 
 
 
497 aa  310  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 
511 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  40.96 
 
 
500 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  40.82 
 
 
497 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  45.7 
 
 
495 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2415  leucyl aminopeptidase  44.03 
 
 
506 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  38.67 
 
 
524 aa  309  8e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  45.41 
 
 
536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  36.91 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  45.75 
 
 
497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  38.45 
 
 
496 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 
497 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  39.1 
 
 
506 aa  307  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  41.08 
 
 
496 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  36.52 
 
 
502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  36.58 
 
 
502 aa  306  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
502 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
502 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
502 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
502 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  36.38 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  43.36 
 
 
530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>