More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1710 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1710  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
501 aa  1004    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.055191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  43.47 
 
 
503 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  45.41 
 
 
496 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.94 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  44.03 
 
 
488 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  42.47 
 
 
511 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  42.39 
 
 
528 aa  350  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.74 
 
 
487 aa  348  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  43.22 
 
 
503 aa  345  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  43.71 
 
 
496 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  40.7 
 
 
503 aa  340  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 
491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  46.09 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  38.1 
 
 
488 aa  323  4e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42 
 
 
492 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  44.29 
 
 
495 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  42.66 
 
 
508 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  44.16 
 
 
496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  41.81 
 
 
496 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  38.67 
 
 
495 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2081  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
497 aa  306  7e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  42.58 
 
 
496 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 
512 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  41.15 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  47.31 
 
 
518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  37.28 
 
 
496 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  36.25 
 
 
495 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  36.45 
 
 
495 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  40.83 
 
 
522 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  45.24 
 
 
499 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  37.45 
 
 
504 aa  297  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  41.41 
 
 
530 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  42.23 
 
 
503 aa  294  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  40.87 
 
 
503 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 
501 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  45.83 
 
 
518 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 
506 aa  292  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 
503 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 
508 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  35.54 
 
 
493 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  36.09 
 
 
497 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 
492 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  37.52 
 
 
497 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  37.62 
 
 
493 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
503 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  41.43 
 
 
508 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  42.63 
 
 
507 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  37.48 
 
 
500 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 
503 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
500 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
498 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  40.84 
 
 
500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  40.55 
 
 
498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  36.53 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 
503 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  36.53 
 
 
497 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  40.27 
 
 
490 aa  282  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  43.32 
 
 
521 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  37.7 
 
 
496 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  38.96 
 
 
500 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  40.41 
 
 
502 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  39.37 
 
 
499 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  37.1 
 
 
495 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  36.58 
 
 
493 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  35.18 
 
 
497 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
524 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 
499 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2057  Leucyl aminopeptidase  42 
 
 
491 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4247  Leucyl aminopeptidase  45.57 
 
 
518 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  37.7 
 
 
496 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  34.39 
 
 
497 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
511 aa  276  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4222  Leucyl aminopeptidase  43.24 
 
 
518 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  34.78 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  35.62 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  38.43 
 
 
510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  35.32 
 
 
491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  38.28 
 
 
500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  38.11 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3023  leucyl aminopeptidase  39.86 
 
 
502 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1317  leucyl aminopeptidase  36.33 
 
 
483 aa  274  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0233477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
498 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  43.57 
 
 
462 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  38.32 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  38.74 
 
 
507 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  36.65 
 
 
495 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  39.36 
 
 
497 aa  273  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2108  leucyl aminopeptidase  37.55 
 
 
489 aa  273  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  36.82 
 
 
491 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  36.33 
 
 
502 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
503 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
503 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
503 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>