117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0133 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0133  PHP domain protein  100 
 
 
233 aa  487  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000141938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0099  PHP domain protein  96.14 
 
 
233 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0756  phosphotransferase domain-containing protein  92.7 
 
 
233 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.803092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0129  PHP domain protein  84.55 
 
 
235 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0145  PHP domain protein  84.55 
 
 
235 aa  417  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.250685  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1254  phosphoesterase PHP-like  70.39 
 
 
260 aa  343  8.999999999999999e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0378  phosphotransferase domain-containing protein  49.14 
 
 
250 aa  259  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000646599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  30.7 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  29.49 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  26.38 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  29.86 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  28.5 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  26.15 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  29.58 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  25.74 
 
 
297 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  25.78 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  29.29 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  24.38 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
224 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  31.21 
 
 
235 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  26.32 
 
 
216 aa  52  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  27.66 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  32.61 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  25 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  33.63 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  30 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  33.33 
 
 
315 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  27.21 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  53.49 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.45 
 
 
306 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  25.45 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  25.34 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  26.7 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  25.45 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  32.17 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  37.14 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  25.45 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  33.59 
 
 
275 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  57.14 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  57.14 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  28.37 
 
 
480 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  34.78 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  28.17 
 
 
308 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  22.86 
 
 
291 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  26.47 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  33.71 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  28.71 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  30.61 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  35.71 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  48.78 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4577  phosphotransferase domain-containing protein  26.13 
 
 
387 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0604176  normal  0.4279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  27.38 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3335  phosphotransferase domain-containing protein  28.21 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.219071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  44 
 
 
283 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  50 
 
 
288 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  29.7 
 
 
314 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  35.14 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  44.74 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  29.37 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2382  phosphoesterase domain-containing protein  40 
 
 
524 aa  45.1  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  34.23 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  34.23 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10031  metal-dependent phosphoesterase  28.79 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.283504  normal  0.395937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0668  phosphotransferase domain-containing protein  38.89 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  42.31 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  40.82 
 
 
605 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  25.23 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  29.41 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  26.61 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  29.92 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  29.91 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  30.47 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  35.82 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1919  phosphotransferase domain-containing protein  55.56 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  24.35 
 
 
403 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0330  phosphoesterase PHP, N-terminal  27.61 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  31.13 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  29.7 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  47.37 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  46.34 
 
 
288 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  37.88 
 
 
287 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  50 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  38.33 
 
 
294 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  23.47 
 
 
407 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  30.63 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  33.03 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  33.03 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  23.65 
 
 
353 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  54.29 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3419  PHP domain protein  25.93 
 
 
411 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  52.78 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  47.5 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  51.43 
 
 
572 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  29.36 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  33.33 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  42.59 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  47.37 
 
 
572 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  51.43 
 
 
572 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  51.43 
 
 
572 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>