More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1227 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  57.78 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  57.41 
 
 		 272 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  57.45 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  54.26 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  57.14 
 
 		 181 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  45.42 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  48.25 
 
 		 287 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  48.68 
 
 		 295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3780  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 327 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  34.17 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  43.85 
 
 		 369 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  33.89 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.22 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  42.06 
 
 		 386 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  32.32 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 358 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.59 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.13 
 
 		 380 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2583  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 809 aa  95.5  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 386 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  40 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.77 
 
 		 616 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1242  glycosyltransferase  29.39 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000038464  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.38 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 289 aa  92.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1239  hypothetical protein, CgtB glycosyltransferase fragment  91.3 
 
 		 49 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000538256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.15 
 
 		 729 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 		 330 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 		 609 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 355 aa  89.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  41.04 
 
 		 333 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 341 aa  89.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 		 553 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.61 
 
 		 328 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.61 
 
 		 1157 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  44.09 
 
 		 347 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 352 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  36.45 
 
 		 785 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1480  putative glycosyltransferase  29.58 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 		 350 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 341 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  44.09 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  40 
 
 		 1173 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.22 
 
 		 336 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 		 309 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 384 aa  86.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 329 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 		 343 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 348 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  40.52 
 
 		 327 aa  85.9  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 329 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  44.44 
 
 		 102 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.94 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  41.44 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 		 1116 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.94 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.98 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.29 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  27.1 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  43.88 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  20.44 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  33.09 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.77 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>