39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0179 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  100 
 
 		 448 aa  900    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  56.17 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  55.29 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  33.5 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  31.33 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  26.98 
 
 		 457 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  28.06 
 
 		 671 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  22.7 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.06 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  22.13 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  21.03 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  24.21 
 
 		 559 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  21.73 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  21.26 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  22.49 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  21.93 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  23.02 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  23.17 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  20.59 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  20.7 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1218  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 486 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.411043  normal  0.543681 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  21.5 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  21.56 
 
 		 534 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4206  hypothetical protein  40 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  21.71 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>