More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0024 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  80.54 
 
 
442 aa  755  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  79.82 
 
 
447 aa  748  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  77.15 
 
 
442 aa  731  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  89.37 
 
 
442 aa  828  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  89.37 
 
 
442 aa  828  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0055  adenylosuccinate lyase  75.96 
 
 
442 aa  684  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  79.37 
 
 
443 aa  743  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0024  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
442 aa  918  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.938099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  70.81 
 
 
443 aa  677  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  89.14 
 
 
442 aa  827  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  58.05 
 
 
431 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  57.37 
 
 
431 aa  517  1e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  57.14 
 
 
431 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  56.69 
 
 
431 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  56.46 
 
 
431 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  55.56 
 
 
431 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  54.05 
 
 
435 aa  493  1e-138  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  55.18 
 
 
435 aa  492  1e-138  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
435 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  54.73 
 
 
435 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
435 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  54.05 
 
 
438 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 
433 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
433 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  54.28 
 
 
435 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  54.61 
 
 
434 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  53.38 
 
 
445 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  54.73 
 
 
435 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  53.38 
 
 
458 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
434 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  53.74 
 
 
431 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
435 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  52.7 
 
 
435 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  53.15 
 
 
435 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
435 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  52.93 
 
 
435 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 
435 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 
435 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  54.05 
 
 
434 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  54.28 
 
 
435 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  54.05 
 
 
434 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 
433 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  54.5 
 
 
433 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 
435 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  53.15 
 
 
435 aa  469  1e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  52.26 
 
 
432 aa  468  1e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  54.05 
 
 
436 aa  466  1e-130  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  51.48 
 
 
431 aa  467  1e-130  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  53.06 
 
 
437 aa  465  1e-130  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  52.25 
 
 
434 aa  466  1e-130  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 
431 aa  459  1e-128  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 
437 aa  461  1e-128  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
435 aa  460  1e-128  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 
450 aa  461  1e-128  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  52.15 
 
 
435 aa  454  1e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  52.15 
 
 
435 aa  454  1e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  48.75 
 
 
431 aa  454  1e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 
435 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 
438 aa  447  1e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  48.98 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  48.98 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  48.98 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  48.53 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  48.98 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 
439 aa  446  1e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  48.98 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  48.06 
 
 
431 aa  445  1e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  50.79 
 
 
430 aa  446  1e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  48.75 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  48.98 
 
 
435 aa  447  1e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  48.75 
 
 
435 aa  446  1e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 
435 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 
451 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  47.85 
 
 
433 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 
439 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
431 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  52.47 
 
 
438 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 
439 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
432 aa  439  1e-122  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 
433 aa  438  1e-122  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  48.75 
 
 
430 aa  439  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 
439 aa  439  1e-122  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
431 aa  439  1e-122  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
431 aa  440  1e-122  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
431 aa  440  1e-122  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 
430 aa  440  1e-122  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  48.52 
 
 
431 aa  440  1e-122  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  48.29 
 
 
451 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  48.52 
 
 
451 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  48.06 
 
 
431 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  48.06 
 
 
431 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
431 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  47.61 
 
 
430 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
434 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 
438 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 
431 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  48.06 
 
 
430 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 
434 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  48.75 
 
 
432 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  47.61 
 
 
431 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>