88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2969 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  634    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  54.73 
 
 
319 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  49.67 
 
 
307 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  49.08 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  48.26 
 
 
306 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  45.48 
 
 
317 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  50.92 
 
 
351 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  41.56 
 
 
331 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  43.01 
 
 
297 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  35.46 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  35.46 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  35.46 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  36.29 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  36.29 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  39.21 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  33.08 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  44 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  32.37 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  45.37 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  33.47 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  34.63 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  32.71 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  32.71 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  32.71 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  34.03 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  34.03 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.51 
 
 
300 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  41.13 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  36 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  36 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  36 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.95 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  33.01 
 
 
294 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.85 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  29.82 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  29.05 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  32.68 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  28.8 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  32.54 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  28.51 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  28.51 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  31.76 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  31.76 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  34.32 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.76 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  32.86 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  31.92 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  32.47 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  37.5 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  33.8 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  33.66 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.23 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  32.39 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  32.39 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  32.82 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  37.86 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  30.2 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  30.49 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  27.42 
 
 
306 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  28.98 
 
 
286 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.44 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  32.1 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.29 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  27.63 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  34.33 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  31.72 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  30.74 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  28.77 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.2 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  31.03 
 
 
306 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  32.23 
 
 
120 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  32.35 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  32.08 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  36.36 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  36.75 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  27.52 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  31.82 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  34.55 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  33.12 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  25.47 
 
 
201 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  26.7 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  26.7 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  26.7 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.46 
 
 
262 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>