32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4023 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  66.12 
 
 
307 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  50.5 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  45.48 
 
 
333 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  41.82 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  41.16 
 
 
328 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  46.72 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  42.91 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  39.86 
 
 
297 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  29.94 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  29.22 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  29.22 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  29.22 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  31.29 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  31.29 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  27.83 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  28.48 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.62 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  32.39 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32.68 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  32.05 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  40 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  28.94 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  32.3 
 
 
424 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  30.49 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  28.28 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.04 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  30.82 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  33.87 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  29.57 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  28.4 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>