More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12920 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  100 
 
 
310 aa  631  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  67.06 
 
 
270 aa  342  5e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0402  FeS assembly ATPase SufC  62.35 
 
 
255 aa  323  2e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000798388  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2270  FeS assembly ATPase SufC  67.08 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
257 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  49.17 
 
 
257 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  49.56 
 
 
257 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  49.34 
 
 
266 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  48.7 
 
 
256 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  50.44 
 
 
259 aa  232  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  49.34 
 
 
257 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  48.71 
 
 
257 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
253 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  46.12 
 
 
250 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  46.96 
 
 
256 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  49.12 
 
 
258 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  47.5 
 
 
249 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  48.71 
 
 
267 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  47.84 
 
 
252 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  46.67 
 
 
243 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  47.95 
 
 
252 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  47.83 
 
 
253 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.93 
 
 
255 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  45.75 
 
 
255 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 
248 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  47.37 
 
 
253 aa  222  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  46.55 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  44.53 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  46.22 
 
 
253 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  44.17 
 
 
247 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  46.05 
 
 
252 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  45.16 
 
 
252 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  46.03 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  46.12 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  47.74 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  43.57 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  42.62 
 
 
258 aa  219  6e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  47.11 
 
 
253 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  48.47 
 
 
262 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  44.9 
 
 
253 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  46.75 
 
 
252 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  44.53 
 
 
250 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  48.47 
 
 
265 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  45.63 
 
 
253 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  45.75 
 
 
253 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  45.63 
 
 
253 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  43.67 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  44.64 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  45.16 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  44.36 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  45.31 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  44.9 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  45 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 
261 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  44.22 
 
 
250 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  49.35 
 
 
246 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  43.86 
 
 
259 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  49.35 
 
 
246 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  44.3 
 
 
252 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  44.78 
 
 
251 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  45.34 
 
 
253 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  45.68 
 
 
250 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  44.83 
 
 
254 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
256 aa  209  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  43.15 
 
 
281 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  43.39 
 
 
249 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  45.27 
 
 
250 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  45.42 
 
 
252 aa  208  8e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  45.31 
 
 
249 aa  208  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  42.04 
 
 
248 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  43.95 
 
 
254 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  44.35 
 
 
251 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  42.58 
 
 
263 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  43.44 
 
 
261 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  44.9 
 
 
248 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  43.28 
 
 
248 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  41.87 
 
 
253 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  44.03 
 
 
256 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
250 aa  206  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  43.9 
 
 
250 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  42.51 
 
 
251 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  45.23 
 
 
266 aa  205  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  45.87 
 
 
257 aa  205  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  43.72 
 
 
261 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  42.98 
 
 
248 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  42.98 
 
 
248 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  44.21 
 
 
247 aa  205  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  42.98 
 
 
248 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  42.98 
 
 
248 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  42.98 
 
 
248 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  42.51 
 
 
248 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 
247 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  43.85 
 
 
259 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  43.85 
 
 
263 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  42.34 
 
 
259 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>