42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2808 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  64.62 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  63.18 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  41.77 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  41.34 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  40.08 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  41.04 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  40.64 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  40.39 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  40.39 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  38.06 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  38.06 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  38.06 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  38.06 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  42.92 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  38.13 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  37.3 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  37.25 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  37.95 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  30.45 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  23.98 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  39.58 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  31.37 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  40.91 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0047  nucleotidyltransferase domain-containing protein  21.03 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  26.11 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  28.51 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  23.15 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  25.19 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1526  hypothetical protein  28.31 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3552  nucleotidyltransferase  25.58 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4676  nucleotidyltransferase  21.69 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4657  nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5092  nucleotidyltransferase domain protein  30.43 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>