58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0318 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
387 aa  784    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  49.34 
 
 
388 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  49.34 
 
 
388 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  49.34 
 
 
388 aa  332  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  48.09 
 
 
384 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  47.83 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  47.83 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  47.83 
 
 
384 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  47.83 
 
 
384 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  47.55 
 
 
384 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  47.55 
 
 
384 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  47.55 
 
 
384 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  47.01 
 
 
380 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  47.28 
 
 
384 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  45.33 
 
 
397 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  43.15 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  42.64 
 
 
390 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  44.24 
 
 
386 aa  316  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  43.72 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  43.98 
 
 
386 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  43.98 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  42.31 
 
 
388 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  39.63 
 
 
395 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.63 
 
 
395 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  40.72 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  41.36 
 
 
384 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  43.78 
 
 
384 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  40.71 
 
 
377 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  38.65 
 
 
376 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  36.43 
 
 
384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  38.6 
 
 
388 aa  249  8e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  31.01 
 
 
400 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.76 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  25.4 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  27.5 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  22.64 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.35 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  27.21 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  25.19 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.29 
 
 
612 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.51 
 
 
612 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.97 
 
 
613 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3539  sugar isomerase (SIS)  27.65 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632744  normal  0.722718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.58 
 
 
612 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000269055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.81 
 
 
586 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.78 
 
 
611 aa  46.2  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16620  predicted phosphosugar isomerase  26.14 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.816556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0799  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  25.65 
 
 
612 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5182  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.96 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.02 
 
 
607 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.02 
 
 
605 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.32 
 
 
605 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.46 
 
 
591 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.57 
 
 
613 aa  43.5  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.02 
 
 
605 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.54 
 
 
614 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  28.96 
 
 
606 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>