181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0242 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  100 
 
 
138 aa  279  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  73.88 
 
 
142 aa  204  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  70.99 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  53.44 
 
 
133 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  141  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  52.27 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  48.48 
 
 
148 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  44.03 
 
 
137 aa  130  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  50 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  41.98 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  49.24 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  43.28 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  44.7 
 
 
135 aa  124  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3598  hypothetical protein  50.39 
 
 
125 aa  123  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289311  normal  0.0163526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  44.36 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  44.36 
 
 
137 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  43.61 
 
 
137 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0496  protein of unknown function DUF55  50.83 
 
 
132 aa  121  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  46.32 
 
 
141 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  47.33 
 
 
138 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  42.11 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  45.45 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  43.94 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  45.9 
 
 
131 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  41.79 
 
 
147 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  45.97 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  40.6 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  39.85 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  39.85 
 
 
138 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  43.07 
 
 
139 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  39.85 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  41.04 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  40.6 
 
 
139 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  41.35 
 
 
140 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  40.6 
 
 
137 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  41.35 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  41.35 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  37.59 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  40.6 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  40.6 
 
 
139 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  34.85 
 
 
132 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  41.5 
 
 
150 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  102  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  40.15 
 
 
147 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  39.39 
 
 
137 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  39.39 
 
 
141 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  38.24 
 
 
135 aa  100  8e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  37.41 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  36.84 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  33.08 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  42.95 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  40.85 
 
 
189 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  34 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  34 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  37.67 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  34.25 
 
 
152 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  38 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  38.96 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  36.3 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  39.1 
 
 
156 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  35.34 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  36.42 
 
 
152 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  39.6 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  36.18 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  38.16 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  38.93 
 
 
156 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  35.82 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  38.16 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  37.24 
 
 
152 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  35.53 
 
 
155 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  38.67 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  37.16 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  38.67 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  35.48 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  35.76 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  34.33 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  37.86 
 
 
153 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  33.58 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  36.76 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  36.76 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  34.67 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15461  hypothetical protein  33.56 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.439189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  35.46 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  35.53 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>