32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1887 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  52.63 
 
 
216 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  50.48 
 
 
214 aa  187  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  55.83 
 
 
209 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  44.17 
 
 
208 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  48.06 
 
 
206 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  45.56 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  39.32 
 
 
209 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  36.5 
 
 
211 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  31.58 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  30.77 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  27.98 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  28.25 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  31.61 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  24.31 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  24.31 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  31.58 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  23.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  23.85 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  37.65 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  22.96 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  21.3 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  22.94 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  26.35 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  21.83 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  26.87 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23.85 
 
 
191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  37.68 
 
 
154 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  24.03 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  28.75 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  23.85 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.85 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>