182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0253 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 557 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1295  urocanate hydratase  58.98 
 
 		 554 aa  651    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0784383  normal  0.0497778 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0707  urocanate hydratase  58.89 
 
 		 564 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.760092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  57.07 
 
 		 601 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  66.11 
 
 		 552 aa  736    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  60.58 
 
 		 564 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3684  urocanate hydratase  66.11 
 
 		 552 aa  736    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 557 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  60.22 
 
 		 607 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  65.93 
 
 		 552 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  66.11 
 
 		 552 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  66.11 
 
 		 552 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0647  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  57.79 
 
 		 554 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  57.61 
 
 		 554 aa  656    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 565 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 557 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  59.17 
 
 		 566 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 559 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0150  urocanate hydratase  59.35 
 
 		 577 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 560 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2936  urocanase  61.08 
 
 		 908 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  59.45 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  65.93 
 
 		 552 aa  736    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  65.93 
 
 		 552 aa  736    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1532  urocanate hydratase  60.18 
 
 		 562 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  60.55 
 
 		 562 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1508  urocanate hydratase  61.4 
 
 		 546 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  59.6 
 
 		 579 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  61.01 
 
 		 572 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2945  urocanate hydratase  60 
 
 		 562 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2359  urocanate hydratase  61.51 
 
 		 546 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.629943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1930  urocanate hydratase  57.89 
 
 		 572 aa  644    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  59.71 
 
 		 568 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 559 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  61.71 
 
 		 557 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2735  urocanate hydratase  62.73 
 
 		 565 aa  697    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3759  urocanate hydratase  66.3 
 
 		 552 aa  738    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5930  urocanate hydratase  59.01 
 
 		 557 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.138114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  59.63 
 
 		 562 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  67.59 
 
 		 554 aa  741    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  61.17 
 
 		 566 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 568 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1100  urocanate hydratase  59.45 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2983  urocanate hydratase  58.92 
 
 		 562 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.41142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03127  urocanate hydratase  60.84 
 
 		 563 aa  658    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2187  urocanate hydratase  59.63 
 
 		 562 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0917  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 561 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1601  urocanate hydratase  60.55 
 
 		 555 aa  653    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.308587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2209  urocanate hydratase  59.27 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  60.77 
 
 		 559 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0374  urocanate hydratase  70.74 
 
 		 564 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  59.63 
 
 		 562 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  60.55 
 
 		 570 aa  675    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2086  urocanate hydratase  59.27 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0940  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 561 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00715979  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 557 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  76.22 
 
 		 555 aa  860    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1000  urocanate hydratase  76.84 
 
 		 549 aa  852    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1030  urocanate hydratase  58.53 
 
 		 559 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.235061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3646  urocanate hydratase  59.71 
 
 		 573 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.455234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2921  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1580  urocanate hydratase  61.26 
 
 		 560 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21091  normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0885  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 561 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2665  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2552  urocanate hydratase  58.8 
 
 		 555 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2721  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1679  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 562 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  64.77 
 
 		 549 aa  720    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 563 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  77.21 
 
 		 549 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  60.22 
 
 		 561 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2881  urocanate hydratase  59.53 
 
 		 572 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  60.59 
 
 		 553 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  66.06 
 
 		 552 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0823  urocanate hydratase  60.55 
 
 		 565 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000435883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0826  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 561 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6450  urocanate hydratase  58.64 
 
 		 556 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  62.57 
 
 		 553 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1557  urocanate hydratase  65.93 
 
 		 552 aa  736    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0743786  normal  0.0292483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  58.62 
 
 		 555 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 557 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0852  urocanate hydratase  56.36 
 
 		 573 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.371029  hitchhiker  0.00893346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  62.57 
 
 		 550 aa  707    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4656  urocanate hydratase  60.48 
 
 		 559 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312199  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  62.57 
 
 		 553 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  59.34 
 
 		 563 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  60.62 
 
 		 559 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4452  urocanate hydratase  75.23 
 
 		 554 aa  833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0891581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0854  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 561 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3661  urocanate hydratase  66.11 
 
 		 552 aa  736    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  65.93 
 
 		 552 aa  730    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  62.06 
 
 		 546 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 563 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  63.37 
 
 		 549 aa  683    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02073  urocanate hydratase  59.63 
 
 		 565 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1812  urocanate hydratase  59.82 
 
 		 562 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596639  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  61.14 
 
 		 593 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>