47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4399 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  65.22 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  64.03 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  62.91 
 
 		 284 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  62.23 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  61.51 
 
 		 273 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  61.51 
 
 		 273 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  61.96 
 
 		 274 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  61.96 
 
 		 274 aa  362  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  61.15 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  60.87 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  61.96 
 
 		 274 aa  358  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  61.59 
 
 		 273 aa  358  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  59.78 
 
 		 273 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  59.78 
 
 		 274 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  57.76 
 
 		 272 aa  347  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  55.52 
 
 		 315 aa  345  7e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  56.23 
 
 		 274 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  59.18 
 
 		 265 aa  338  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  55.87 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  56.12 
 
 		 277 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  57.2 
 
 		 267 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  57.93 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  58.3 
 
 		 266 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  55.68 
 
 		 266 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  55.8 
 
 		 276 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  56.16 
 
 		 276 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  55.8 
 
 		 276 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  58.4 
 
 		 265 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  56.09 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  51.97 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  57.5 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  53.99 
 
 		 275 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  51.79 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  56.33 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  51.44 
 
 		 274 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  45.99 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  45.99 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  38.72 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  39.15 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  40.71 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  41.02 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  22.31 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  23.88 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  24.12 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  22.55 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1345  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>