More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2368 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  100 
 
 
537 aa  1119    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  55.14 
 
 
564 aa  571  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  55.85 
 
 
559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  32.18 
 
 
520 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  33.59 
 
 
515 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  33.53 
 
 
523 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  31.84 
 
 
511 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  33.81 
 
 
511 aa  260  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  32.21 
 
 
526 aa  257  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  32.66 
 
 
522 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  33.47 
 
 
506 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  33.33 
 
 
549 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  33.07 
 
 
552 aa  243  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  32.11 
 
 
483 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  32.26 
 
 
474 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  32.79 
 
 
478 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1033  sulfatase  30.73 
 
 
581 aa  228  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  30.46 
 
 
537 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  31 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  34.26 
 
 
492 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  30.88 
 
 
477 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  30.82 
 
 
453 aa  200  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  30.38 
 
 
493 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  29.91 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  30.53 
 
 
498 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  30.74 
 
 
479 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  31.01 
 
 
513 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2114  sulfatase  32.83 
 
 
484 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.711307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  30.82 
 
 
534 aa  180  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  30.38 
 
 
517 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.48 
 
 
526 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  29.66 
 
 
501 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  29.03 
 
 
490 aa  174  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.58 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  28.83 
 
 
479 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.58 
 
 
478 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.72 
 
 
499 aa  171  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.13 
 
 
474 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  36.84 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.51 
 
 
481 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  30.73 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  30.5 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.24 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  26.44 
 
 
496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  28.13 
 
 
480 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  28.93 
 
 
620 aa  163  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28.26 
 
 
459 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.45 
 
 
494 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  27.38 
 
 
535 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0627  sulfatase  28.02 
 
 
474 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  29.29 
 
 
487 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  28.48 
 
 
471 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.73 
 
 
497 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  28.18 
 
 
480 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.95 
 
 
497 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.95 
 
 
497 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.95 
 
 
497 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  28.38 
 
 
505 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  28.17 
 
 
497 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.11 
 
 
489 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.35 
 
 
497 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.46 
 
 
467 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  28.39 
 
 
518 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  28.69 
 
 
505 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  30.1 
 
 
492 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  29.61 
 
 
501 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  28.63 
 
 
491 aa  158  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.79 
 
 
498 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.73 
 
 
497 aa  158  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  29.39 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.45 
 
 
505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  26.73 
 
 
458 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3902  sulfatase  29.31 
 
 
522 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.63 
 
 
519 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  28.33 
 
 
505 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  25.31 
 
 
514 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.77 
 
 
517 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  28.42 
 
 
523 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.07 
 
 
500 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  28.57 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.26 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  28.69 
 
 
505 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  28.97 
 
 
517 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  29.13 
 
 
511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.91 
 
 
491 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  27.34 
 
 
481 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  28.74 
 
 
517 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.73 
 
 
497 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  27.98 
 
 
470 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  26.77 
 
 
495 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.19 
 
 
470 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  27.39 
 
 
512 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  28.74 
 
 
522 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  28.74 
 
 
522 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  28.74 
 
 
522 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  28.74 
 
 
522 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  28.74 
 
 
522 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  28.91 
 
 
509 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  28.14 
 
 
520 aa  150  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.98 
 
 
503 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>