More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1874 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  97.63 
 
 
380 aa  749    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  100 
 
 
380 aa  766    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  43.12 
 
 
385 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  43.12 
 
 
387 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  43.12 
 
 
387 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  43.12 
 
 
387 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  42.86 
 
 
387 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  42.59 
 
 
387 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  42.33 
 
 
387 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  42.71 
 
 
387 aa  332  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  42.86 
 
 
387 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  42.86 
 
 
387 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  43.34 
 
 
407 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  42.59 
 
 
387 aa  328  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  42.44 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  42.44 
 
 
388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  42.02 
 
 
396 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  40.68 
 
 
385 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  39.42 
 
 
388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  41.49 
 
 
396 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  40.9 
 
 
386 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  41.76 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  40.73 
 
 
396 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  41.91 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  40.47 
 
 
396 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  40.69 
 
 
396 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  39.37 
 
 
390 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  39.1 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
392 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  39.19 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  40.49 
 
 
404 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  39.67 
 
 
387 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.63 
 
 
390 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  37.53 
 
 
393 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  40.16 
 
 
390 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  39.89 
 
 
385 aa  296  4e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 
385 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 
395 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.75 
 
 
386 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  38.26 
 
 
401 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  39.37 
 
 
396 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  38.26 
 
 
385 aa  285  8e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.46 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 
391 aa  282  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  35.48 
 
 
387 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  40.59 
 
 
398 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 
405 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  37.74 
 
 
393 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  37.27 
 
 
391 aa  279  6e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
398 aa  277  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 
402 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  39.78 
 
 
398 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  36.68 
 
 
388 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  36.8 
 
 
383 aa  275  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  35.48 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 
410 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  36.17 
 
 
391 aa  271  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  36.91 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  37.53 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  36.86 
 
 
381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  37.27 
 
 
367 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  36.44 
 
 
387 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 
400 aa  266  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 
381 aa  265  7e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 
399 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  36.97 
 
 
375 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  35.62 
 
 
386 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.63 
 
 
387 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  37.23 
 
 
375 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  38.62 
 
 
394 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  37.74 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.96 
 
 
379 aa  262  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  35.68 
 
 
397 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  36.86 
 
 
380 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  34.9 
 
 
394 aa  260  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  37.93 
 
 
399 aa  259  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  34.33 
 
 
394 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  36.7 
 
 
375 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 
368 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
375 aa  255  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  37.08 
 
 
401 aa  255  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  33.69 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  35.83 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  37 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  35.66 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  35.04 
 
 
371 aa  248  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  34.67 
 
 
379 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  34.85 
 
 
373 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  34.55 
 
 
386 aa  246  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 
395 aa  243  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  35.89 
 
 
373 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.2 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>