239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0535 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0535  flavodoxin family protein  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0519  putative acyl carrier protein phosphodiesterase 1  98.62 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.64 
 
 		 213 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.88 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  36.36 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  33.33 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  33.33 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  36.04 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.64 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.18 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.17 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  26.29 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  27.51 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  27.51 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  26.98 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  26.46 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  26.46 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  26.46 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  26.73 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  26.46 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  26.46 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  26.46 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  28.49 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  27.96 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  27.96 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  27.96 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1070  hypothetical protein  32.14 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  27.42 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  27.42 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  29 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  27.42 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  29 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  27.42 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  29 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  29 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  30.73 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  27.42 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  29 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  27.55 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  28.5 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0908  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  28.35 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0966  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  29.23 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  28.5 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.04 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.04 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  23.83 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  23.96 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  25.27 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  25.94 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.12 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.74 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.79 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.84 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.19 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.84 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.44 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  22.44 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.24 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  21.46 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.73 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  26.73 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.85 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.19 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  26.42 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.89 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.59 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.5 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2014  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.77 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000341313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  23.56 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.83 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  27.05 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.13 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.38 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  25.12 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  19.72 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.56 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  26.67 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.5 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  25.7 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  23.71 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0022  azoreductase  26.17 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  23.71 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  25.7 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.51 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.58 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0386  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.01 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.17 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.44 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  25.25 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.2 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.19 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  25.7 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.51 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>