271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK03080 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  78.57 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28444  mitochondrial ribosomal L36 protein  70 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0515598  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  63.16 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 39 aa  59.3  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  68.42 
 
 		 39 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  65.79 
 
 		 39 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  60.47 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1844  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  68.42 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0673  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 41 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  68.42 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 37 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  52.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0310  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.696988  normal  0.327601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  56.82 
 
 		 46 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  62.5 
 
 		 41 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  65 
 
 		 41 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>