More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1333 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  74.29 
 
 		 229 aa  334  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  71.29 
 
 		 214 aa  326  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  66.03 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  65.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  63.33 
 
 		 223 aa  293  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  63.81 
 
 		 225 aa  287  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  59.43 
 
 		 223 aa  276  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  53.27 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  53.27 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  53.27 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  53.27 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  53.27 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  53.27 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  52.26 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  52.26 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  52.26 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  52.26 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  49.76 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  52.31 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  51.79 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  47.69 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  48.98 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  53.07 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  51.06 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  48.72 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  47.96 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  51.7 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  54.09 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  44.38 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  45.56 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  41.36 
 
 		 220 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  45.65 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 		 185 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  48.15 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  48.86 
 
 		 189 aa  158  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 		 188 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  40.45 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  46.52 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  42.46 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  46.63 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  41.92 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  43.48 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  42.63 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  44.68 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  43.24 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  39.61 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  41.51 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  39.3 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  40.66 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 		 181 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  41.46 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  43.17 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  41.44 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  43.46 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>