146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0180 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  100 
 
 		 79 aa  140  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  80.65 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  62.5 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  61.11 
 
 		 73 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  63.38 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  69.49 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  60.87 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  61.43 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  58.57 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  58.57 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  59.42 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  79.59 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  59.15 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  61.67 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  61.67 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  66.04 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  68.75 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60.78 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  55.17 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  75 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  51.67 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  61.36 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  39.44 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03045  hypothetical protein  60.98 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  42.11 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  39.68 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  37.7 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  44.12 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  34.43 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.16 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  36.23 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  35.48 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.45 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1300  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.62 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  39.34 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  31.88 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  37.93 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  37.1 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  39.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  37.93 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  39.44 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>