More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0091 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0091  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
141 aa  288  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.453795  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  77.3 
 
 
141 aa  234  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  75.89 
 
 
141 aa  233  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1770  50S ribosomal protein L16  75.89 
 
 
141 aa  232  1e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  3.06557e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  75.18 
 
 
141 aa  231  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  75.89 
 
 
141 aa  230  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  75.89 
 
 
141 aa  230  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  75.89 
 
 
141 aa  230  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  74.47 
 
 
141 aa  221  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  70.21 
 
 
141 aa  211  4e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
140 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
140 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47904e-12 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 
145 aa  177  3e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  177  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.21172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
137 aa  176  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  57.55 
 
 
140 aa  176  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  56.83 
 
 
140 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.19005e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 
141 aa  173  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.40858e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
144 aa  172  1e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  54.68 
 
 
140 aa  172  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  60.45 
 
 
144 aa  172  2e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  58.52 
 
 
137 aa  171  3e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 
144 aa  171  4e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 
144 aa  171  4e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  54.68 
 
 
140 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.66771e-08  hitchhiker  4.46584e-09 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  53.96 
 
 
140 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  56.12 
 
 
139 aa  171  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  58.91 
 
 
137 aa  170  6e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  58.91 
 
 
137 aa  170  6e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 
137 aa  169  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
138 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 
138 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  58.39 
 
 
145 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.94235e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  57.55 
 
 
140 aa  168  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  55.15 
 
 
139 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0476  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
136 aa  167  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0462501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
136 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
147 aa  167  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.21329e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
138 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
138 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
138 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  56.62 
 
 
139 aa  167  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
137 aa  166  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  55.8 
 
 
139 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  54.74 
 
 
139 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  55.07 
 
 
139 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  55.8 
 
 
151 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 
138 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 
137 aa  165  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
139 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
145 aa  164  3e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.06256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  57.78 
 
 
139 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  54.48 
 
 
137 aa  164  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39211e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 
137 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 
139 aa  164  6e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
144 aa  163  6e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  56.72 
 
 
140 aa  163  6e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 
139 aa  164  6e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
144 aa  163  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
138 aa  163  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 
142 aa  163  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  55.47 
 
 
139 aa  162  1e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
136 aa  162  1e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 
138 aa  162  1e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  57.78 
 
 
145 aa  162  1e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
136 aa  162  1e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.59558e-09  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001735  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  55.56 
 
 
136 aa  162  1e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.45291e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  53.68 
 
 
138 aa  162  1e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 
136 aa  162  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.39067e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
136 aa  161  2e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.12231e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  54.81 
 
 
136 aa  162  2e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  54.41 
 
 
137 aa  162  2e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 
137 aa  162  2e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  1.06632e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
145 aa  162  2e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
137 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
137 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
137 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 
136 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.00282e-07  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  56.12 
 
 
139 aa  161  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  3.2781e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  55.56 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  161  4e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  4e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  9.7682e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
137 aa  161  4e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  8.77255e-09  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43497e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.49796e-06  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.88504e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.49988e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.14919e-05  hitchhiker  6.83618e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  55.8 
 
 
141 aa  160  5e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.0598e-06  normal  0.151194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.22385e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.50628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 
136 aa  160  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>