35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1237 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  100 
 
 
261 aa  517  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  49.62 
 
 
279 aa  250  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  48.22 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  47.71 
 
 
307 aa  231  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  42.75 
 
 
283 aa  181  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  43.72 
 
 
292 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  43.29 
 
 
292 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  43.29 
 
 
273 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  30.89 
 
 
313 aa  99.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  29.3 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  28.02 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  27.72 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  27.95 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  31.58 
 
 
457 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  33.76 
 
 
461 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  25.58 
 
 
474 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  25.81 
 
 
460 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.36 
 
 
431 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  26.37 
 
 
463 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  32.37 
 
 
463 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  30.71 
 
 
450 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  28.41 
 
 
462 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  25.61 
 
 
464 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  23.39 
 
 
470 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  24.69 
 
 
462 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.38 
 
 
464 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25 
 
 
469 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  29.29 
 
 
420 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  27.62 
 
 
460 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  32.69 
 
 
472 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  22.16 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  27.08 
 
 
463 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  25.48 
 
 
456 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  23.76 
 
 
469 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  29.41 
 
 
454 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>